НИИ АЭМ ТУСУР создан Постановлением Совета Министров РСФСР № 115 от 22.02.68 г. при Томском политехническом институте, приказом Минвуза РСФСР № 1877-р от 23.10.72 г. переведен в ТУСУР (ТИАСУР).
В настоящее время численность штатных сотрудников института составляет 213 человек. институт работает в составе 7 научных отделов, опытно-экспериментального производства и ряда вспомогательных подразделений.
Институт дважды проходил государственную аккредитацию как научная организация в 1999 г. и 2002 г., имеет лицензии по основным видам деятельности, аттестован по системе менеджмента качества (Руководство по качеству СТО 02070246.01-2005).
НИИ АЭМ ТУСУР – коллективный член Федерации космонавтики Российской Федерации.